笨港縣丞署是位在臺灣嘉義縣新港鄉的一個建於清朝乾隆年間的古代建築物，初期設置笨港公館，在15年後一位福建總督劉世明覺得笨港的煙戶繁多，因而設立縣丞一名，實際上並未有人知道縣丞署真正的地點在哪，僅確認它真正地點是位在新港鄉大興宮後廂房，曾經屬於縣丞辦公處，1999年1月至3月期間，科博館派出考古團隊在該地區挖出186平方公尺的深處後，才確定建築物的位置。