特別行政區是一國兩制下的產物，可和自己的祖國行不同的政治制度，也就是僅政治上與祖國有政治獨立的方式。有許多人認為，特別行政區是中華人民共和國政府用來解決台灣問題的管理方式，但是遭到中華民國政府拒絕一國兩制的方式統治台灣，現在中國也只要求只要台灣政府支持統一，什麼都可以談。
另外，中國共產黨前領導人鄧小平曾經表示，只要台灣和平統一，就讓台灣高度自治，比香港和澳門還要高度的自治，不但中央不派軍隊去台灣，台灣還可以擁有自己的軍隊、司法的獨立性以及政治的自治等，中央政府還留一個位子給台灣。
