特别行政区是一国两制下的产物，可和自己的祖国行不同的政治制度，也就是仅政治上与祖国有政治独立的方式。有许多人认为，特别行政区是中华人民共和国政府用来解决台湾问题的管理方式，但是遭到中华民国政府拒绝一国两制的方式统治台湾，现在中国也只要求只要台湾政府支持统一，什么都可以谈。
另外，前中国国家主席邓小平曾经表示，只要台湾和平统一，就让台湾高度自治，比香港和澳门还要高度的自治，不但中央不派军队去台湾，台湾还可以拥有自己的军队、司法的独立性以及政治的自治等，中央政府还留一个位子给台湾。
