戊戌政變
新政一開始便遭到慈禧太后的警惕，在光绪帝颁布《定国是诏》4天后，即6月15日，慈禧任命亲信荣禄代理直隶总督兼北洋大臣，紧紧握住军权，同时将支持改革的军机大臣翁同龢罢职遣返回乡，削弱改革派阵营。见此情景，其他几位军机大臣礼亲王世铎、刚毅、钱应溥、廖寿恆、王文韶，除廖寿恆暗中支持改革外，或顽固抵制或明哲保身。刚毅甚至到颐和园向慈禧太后哭诉，请求太后重新训政。
6月25日，慈禧太后命派怀塔布管理圆明园官兵，刚毅管理健锐营。
9月1日，禮部主事王照疏請光緒帝遊歷日本等國，以考察各國情況。懷塔布、许应骙不肯代送。王照彈劾他並到堂親遞，懷塔布不得已允許其代奏。许应骙則上奏彈劾王照“咆哮署堂，藉端挾制。”
9月4日，光绪下令将怀塔布、许应骙、堃岫、徐会沣、溥颋、曾广汉等阻碍变法的礼部六堂官革职。王照赏给三品顶戴，以四品京堂候补，用昭激励。怀塔布老婆与慈禧太后有亲戚关系，逐向太后哭诉。
9月16日（八月初一），光緒在頤和園召見統率新建陆军的直隸按察使袁世凱，面談後昇任他為侍郎候補。另一方面，直隸總督榮祿以英俄開戰，催袁急回天津。
9月17日（八月初二），光绪帝再召见袁世凱。光緒通过杨锐带给康有為密诏，命其即離京到上海。
9月18日（八月初三），御史杨崇伊上书慈禧，称大同学会蛊惑士心，紊乱朝政，引用东人，深恐贻祸宗社，吁恳皇太后即日训政以遏乱葫。
據袁世凱的日記，之後譚嗣同於9月18日去法华寺夜訪袁世凱，透露慈禧聯同榮祿，要廢除光緒；並說皇上希望袁世凱可以起兵勤王，誅殺榮祿及包圍慈禧住的頤和園。兩日後（9月20日），袁世凱回到天津，將譚嗣同的計劃向榮祿報告。也有一种说法是，袁世凯离京前密告给军机大臣礼亲王世铎[1]。
9月19日（八月初四），傍晚慈禧突然离开颐和园，返回大内。光绪帝自是日起迁居瀛台。
9月20日（八月初五），光绪皇帝第三次召见袁世凯，之后袁回天津。光绪皇帝接见日本前首相伊藤博文，亲密交谈。太后垂帘旁听，极为不满，当天深夜又接到荣禄密報，说光绪帝欲软禁太后。康有为离开北京。
9月21日（八月初六），凌晨慈禧太后率卫队囚禁光绪帝于瀛台，然后下诏训政。当天步军统领衙门兵弁围张荫桓宅，搜捕康有为末获，于南海会馆拿获康广仁。
9月24日（八月初九），刚毅奉太后谕令逮捕四军机章京等变法份子。
一種說法是袁世凱的洩密，是光緒政變失敗的原因；但據近年的考證，慈禧及榮祿等早有廢除新政的計劃，二人在袁世凱9月20日洩密以前也已經有部署和防備。9月19日，慈禧回宮，9月21日即臨朝，宣布戒嚴，火車停駛；並即幽禁光緒，廢除新政，搜捕維新黨人。是為戊戌政變，結束了只有一百零三天的維新。維新黨人中，康有為早離開北京，梁啟超逃入日本使館。其他數十人被捕，包括稱為「戊戌六君子」的譚嗣同、楊銳、林旭、劉光第、楊深秀、康廣仁，六人於9月28日斬於菜市口。刚毅亲自监斩。徐致靖處以永遠監禁；張蔭桓則發放新疆。所有新政，除京師大學堂外，一律都被廢止。